評價中壓制備色譜效率的主要指標是單位時間內分離純物質的量，以純組分量和該組分保留時間之比表示，定義為產率。另一指標是允許分離樣品體積，它決定于固定相的負荷和色譜柱尺寸。試劑純度級別低，中壓制備色譜可直接用制備色譜純試劑，或分析純試劑，高壓制備色譜需過濾再用。不用難揮發難分解緩沖鹽或酸堿，否則后處理還要增加除鹽步驟；雖然目前制備色譜儀器也可運行梯度洗脫，但上到工業生產，考慮節約成本，溶劑回收，建議采用等度洗脫。
中壓制備色譜到底是什么？
(1)分析色譜的目的，是分析出混合物中1個(或者幾個)純物質的含量。制備色譜的目的，是從混合物中得到純物質。為了加快分離的時間與提高分離的效率，制備色譜的的進樣品量很大，導致制備色譜柱r的分離負荷的相應加大，也就必須加大色譜柱填料，增大制備色譜的直徑和長度，使用的相對多的流動相。
然而，當色譜柱上樣品負我加大的時候，往往導致柱效急劇下降而得不到純的產品。制備色譜，要解決容量與柱廣效果之間的矛盾，對重現性也要考慮。從經濟上來說。制備色譜要爭取少用填料，少用溶劑，要盡可能多的得到產品。
(2)樣品的前處理：
制備色譜柱子由于處理的樣品多，比分析柱子更容易受污染，所以，必要的前處理就顯得非常的必要。萃取、過濾、結晶、固相萃取等簡單的分離方法，如果用得上，而且還不是很麻煩，就要盡可能多的采用以去掠雜質。
(3)固定相的選擇
硅膠、鍵合固定相(如C18)、離子交換樹脂、聚酰胺、氧化鋁、凝膠等都可以作為色譜柱的填料。有不少文獻報道，對填料可以進行處理提高了分離效果，如，對硅膠進行的硝酸銀(或緩沖液)處理。
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