微波對于不同的反應體系產生的作用不同，它不僅可以加熱物質，而且還可以對產生一些比較細小的變化過程中，加速物質之間的作用，加快反應;也可以推遲物質之間的反應。從上述的總結來看，微波對反應體系的作用是一個相對復雜的過程，至今還未能理順機理的規律，歸納如下：
1、加熱效應
所謂的加熱效應就是指微波在過程中可以對物質進行加熱，大大提高了物質的反應速度。
微波加熱其本質就是過程中的電磁能有效的轉變成熱能。他的轉變和物質中分子的微觀粒子的運動軌跡緊密相連，在但磁場的作用下會產生：電子極化、介電極化、取向極化和原子極化前兩種極化的時間較長，在十秒到十二秒和十秒十三秒之間，要快于微波頻率;后兩種極化的時間則和微波的頻率較為接近，可以將微波能轉變成熱能。
微波的強穿透性可以在物體的內部和外部同時進行加熱，密閉容器的壓力較大，溫度在升高的過程中反應的速度也在不斷的加快，這些都會推進化學反應的速度。
2、催化效應
很多的有機化合物不會直接的吸收微波，主要是通過某種強烈的吸收微波的媒介將微波能傳遞給相對應的物質進而引發化學反應，如果是可以在微波的照射下就可以出現的催化反應就是所謂的微波誘導催化反應，區分于普通的加熱效應，他主要是通過催化劑和其他載體誘導發生的。
3、非熱效應
化學的分支領域中微波已經開始廣泛的應用了，與此同時，傳統的微波加熱效應也受到了強烈的沖擊，通過實驗人們發現微波對化學反應的影響受環境的制約的同時也和微波、化學反應密切相關。
微波可以加快反應，也可以抑制反應，也可以引導出現選擇性的反應的發生。有人利用微波來合成磷酸鋅，這個現象用加熱效應是無法解釋清楚的，在常規情況下，水溶性的磺化鈦青銅是無法產生的，這也說明了非熱效應的存在。
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